烤烟种子细小，播种量相对较多，出苗比较密。拉十字期后幼苗逐渐生长，相互拥挤，有碍生长发育。间苗过晚容易出现拔脖现象，应早间苗。具体做法：拉十字时拔一次大草，疏开簇子苗，以后随烟苗生长，进行间苗2-3次。问苗时要用肥皂水洗手，不要在床内吸烟，以防花叶病的传染。
稀留苗是指与留苗普遍偏密相对而盲的。现在不少地方留苗过密，苗距不足3-4厘米，烟苗大小不一，移栽到大田后生长很不整齐。根据生产实践，留苗距离5-7厘米为好。烟苗根系发达，叶面积大，根重增加。
苗床经常浇水，床土容易板结，不利于烟苗生长。中耕松土能使床土表面疏松，增加通透性，加速肥料分解。特别是深中耕，能促进根系发育，多发侧根和须根，扩大幼苗吸收养分的能力，拔苗时易带土垛，移栽后成活率高。
一般中耕可进行2-3次。第一次结合定苗进行中耕，深度2-3厘米；第二次于第一次之后6-7天进行，可采取小苗搬家的方法，即移动整个烟苗，或用镊子沿烟苗四周深耕，断其主根及侧根，以利多发须根。中耕要结合施肥，促进烟苗生长。
